Eter fenol sering digunakan dalam reka bentuk farmaseutikal sebagai substituen yang bertindak sebagai penerima ikatan hidrogen tetapi bukan penderma ikatan hidrogen; ini membolehkan banyak ubat oral mengikut peraturan lima Lipinski.[8] Dengan menggantikan hidrogen berasid pada fenol dengan kumpulan alkil, ketoksikan fenol juga dikurangkan; LD50 fenol dalam tikus apabila diberikan secara lisan ialah 317 mg/kg, berbanding 3500-4000 mg/kg untuk anisol, metil eter.[9][10] Tambahan pula, eter secara ketara lebih hidrofobik daripada fenol dan boleh lebih mudah diserap oleh sistem penghadaman daripada substituen fenol itu sendiri, dan membenarkan pengambilan ubat-ubatan tersebut secara oral.[11] Contohnya, omeprazol, ubat oral yang merawat refluks asid, mengandungi dua substituen fenol eter.

Disebabkan oleh peningkatan kehidrofobikan eter fenol berbanding dengan fenol tradisional, eter fenol sering terdapat dalam minyak pati tumbuhan.[12] Anetol, sebatian yang lebih ringkas mengandungi hanya satu bahagian fenol eter, adalah komponen utama dalam minyak buah anise. Elemisin, sebatian organik yang berlaku secara semula jadi yang mengandungi tiga bahagian fenol eter, adalah komponen utama dalam minyak buah pala dan cokmar.[13]